Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCBE1Q6UXH8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCBE1Q6UXH8 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms