Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms