Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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