Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 DAZ1-202ENST00000405239 4421 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 COL28A1-201ENST00000399429 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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