Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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BRD3Q15059 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
BRD3Q15059 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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