Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IFT88Q13099 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms