Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms