Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AURKA-203ENST00000371356 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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PTPRAP18433 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRAP18433 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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