Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PTPRCP08575 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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PTPRCP08575 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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PTPRCP08575 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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PTPRCP08575 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
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