Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LRP12Q9Y561 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms