Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms