Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RAB6CQ53S08 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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