Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 Z98884.2-201ENST00000602406 393 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 UNGP3-201ENST00000603734 675 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC004678.2-201ENST00000623695 1002 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FTO-217ENST00000637001 1609 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KRBOX4-201ENST00000298190 1354 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KNG1-203ENST00000447445 1391 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP133-201ENST00000364845 340 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CYP17A1-AS1-201ENST00000369884 491 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRAV4-201ENST00000390426 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.7-201ENST00000392674 281 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RHBDD1-203ENST00000409053 538 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02246-201ENST00000412426 991 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AKR1B1P1-201ENST00000429105 956 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC012363.2-201ENST00000437837 555 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 COX5BP6-201ENST00000454311 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NPSR1-208ENST00000465305 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPL12P5-201ENST00000475149 392 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02082-201ENST00000484765 710 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NUP210P3-201ENST00000506964 388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP003170.1-201ENST00000536944 1030 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC078776.1-201ENST00000546558 562 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms