Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CTXN3Q4LDR2 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CTXN3Q4LDR2 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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