Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RTL8BQ17RB0 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RTL8BQ17RB0 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RTL8BQ17RB0 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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RTL8BQ17RB0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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