Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RBMY2YP-201ENST00000423333 912 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL590648.1-201ENST00000456479 460 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC026415.1-201ENST00000505404 471 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 VN1R67P-201ENST00000568379 913 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
VAMP3Q15836 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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