Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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ITGA9Q13797 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ITGA9Q13797 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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