Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ITGA7Q13683 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms