Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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