Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FAM3AP98173 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms