Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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