Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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