Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP001124.1-201ENST00000529628 385 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005790.1-201ENST00000619774 450 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SF3A3P1-201ENST00000446317 1477 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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BHLHE41Q9C0J9 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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BHLHE41Q9C0J9 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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BHLHE41Q9C0J9 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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BHLHE41Q9C0J9 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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BHLHE41Q9C0J9 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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BHLHE41Q9C0J9 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPL35AP25-201ENST00000584631 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
BHLHE41Q9C0J9 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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