Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MFSD1P1-201ENST00000576210 1327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IL36A-201ENST00000259211 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 S100A7-201ENST00000368722 442 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IGLV6-57-201ENST00000390285 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC074117.1-203ENST00000412749 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P38-201ENST00000431116 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC018641.1-201ENST00000435950 796 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TGFA-IT1-201ENST00000441238 436 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-AS1-203ENST00000441257 585 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P53-201ENST00000441603 946 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008074.1-201ENST00000441630 723 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FGF14-AS1-201ENST00000444686 294 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SNX18P7-201ENST00000454116 635 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HSFX4-201ENST00000457775 1184 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC007163.2-201ENST00000479041 750 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091429.1-201ENST00000486625 651 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC109630.1-201ENST00000558846 730 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC090907.1-201ENST00000558979 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FRG2GP-201ENST00000567870 615 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TAPT1-AS1-203ENST00000573950 510 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AF001548.2-201ENST00000574212 836 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CFAP52-208ENST00000576499 711 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC104564.4-201ENST00000579050 465 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC080037.1-201ENST00000584975 889 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 KIAA1328-209ENST00000592521 1190 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms