Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF304-202ENST00000391705 4313 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 EFHC1-226ENST00000636954 2129 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC092329.4-202ENST00000638174 1989 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC027045.2-201ENST00000634974 1571 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FBXL2-222ENST00000538892 2793 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CX3CR1-206ENST00000542107 3215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP20-1Q3LI63 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms