Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms