Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CMKLR1-202ENST00000412676 5110 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC107884.1-207ENST00000504206 4433 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC02177-201ENST00000564305 5298 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 JCAD-201ENST00000375377 9265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SUPT16H-201ENST00000216297 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MARF1-202ENST00000540441 7105 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 COL12A1-203ENST00000416123 8964 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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HERC1Q15751 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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