Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAM2Q15035 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms