Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK2Q13002 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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