Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVPABLB-1P60509 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVPABLB-1P60509 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms