Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CD4-201ENST00000011653 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TMC3-201ENST00000359440 4641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZNF571-AS1-201ENST00000585578 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MYBPC2-201ENST00000357701 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CACNA1C-201ENST00000327702 6616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 HAP1-202ENST00000341193 3880 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RCAN3-208ENST00000610732 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CD36-214ENST00000447544 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 HMOX2-202ENST00000398595 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GTF2H1-214ENST00000534641 2587 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 VIT-204ENST00000401530 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MCTP2-203ENST00000451018 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NIPAL1-201ENST00000295461 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZFAND4-202ENST00000344646 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TTLL11-IT1-201ENST00000411790 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AP000529.1-201ENST00000417657 1123 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CCDC144NL-AS1-202ENST00000423473 839 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RAB15-202ENST00000426039 683 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 SEMA4D-211ENST00000438547 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 ZNF691-204ENST00000372506 1859 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 BCL2L13-213ENST00000538149 4797 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FAM69A-201ENST00000370310 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TAOK3-209ENST00000537952 2147 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MBLAC2-201ENST00000316610 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 WSCD2-207ENST00000549903 3534 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ABLIM3-205ENST00000504238 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 BARD1-211ENST00000613706 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ITGAE-201ENST00000263087 3858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 EIF2A-203ENST00000460851 2198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CDK14-202ENST00000380050 4995 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TREM1-207ENST00000591620 2048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KIAA1755-201ENST00000279024 6429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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