Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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HOXD10P28358 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
HOXD10P28358 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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