Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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NFKB1P19838 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
NFKB1P19838 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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NFKB1P19838 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NFKB1P19838 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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