Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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ARL2-SNX15V9GYD0 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ARL2-SNX15V9GYD0 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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