Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PDGFDQ9GZP0 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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