Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CAVIN4Q5BKX8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms