Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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RTL8BQ17RB0 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RTL8BQ17RB0 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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