Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KIAA1217-207ENST00000396445 5706 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SVOP-205ENST00000610966 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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