Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SIX1Q15475 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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SIX1Q15475 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SIX1Q15475 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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