Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SSPNQ14714 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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