Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL4A6Q14031 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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