Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ATP1A4Q13733 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms