Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL355472.1-201ENST00000451795 575 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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TOP3AQ13472 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TOP3AQ13472 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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