Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
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TCOF1Q13428 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
TCOF1Q13428 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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