Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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ATG4DQ86TL0 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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ATG4DQ86TL0 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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ATG4DQ86TL0 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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ATG4DQ86TL0 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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ATG4DQ86TL0 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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ATG4DQ86TL0 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
ATG4DQ86TL0 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 CCDC152-201ENST00000361970 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
ATG4DQ86TL0 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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