Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CREM-234ENST00000484283 660 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC073657.1-202ENST00000562063 334 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC012370.2-202ENST00000600508 1099 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC068512.1-201ENST00000584542 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 MTRF1-203ENST00000379480 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ALDOB-201ENST00000374855 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 TTC9C-202ENST00000316461 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC093580.1-201ENST00000420549 671 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
CSPP1Q1MSJ5 AP000757.2-201ENST00000531850 557 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms