Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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NRF1Q16656 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NRF1Q16656 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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