Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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