Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GTF2H3Q13889 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GTF2H3Q13889 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms