Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
IFT88Q13099 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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IFT88Q13099 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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IFT88Q13099 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
IFT88Q13099 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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